الساعة البيولوجية هي ميكانيكة التوقيت والتي تقوم تعمل داخل الكائنات الحية، وهي التي تقوم بالتحكم المتناسق للوظائف والعمليات في الكائنات الحية مثل السبات الشتوي للدببة والنشاط الليلي لبعض الحيوانات مثل الخفاش وهي في بعض الأحيان موجودة في الانسان مثل موعد الاستيقاظ اليومي في نفس الموعد.