قد يؤدي الانتقال الى النظام الغذائي النباتي الى نقص المغذيات الرئيسية التي يحتاجها الجسم، خاصة الفيتامينات والمعادن. كما أنه يتسبب في انخفاض مستوى الكرياتين؛ وهو عبارة عن حمض أميني ضروري لقوة العضلات، موجود في اللحوم والأسماك التي لا يتناولها النباتيون. وقد يرتفع مستوى الكوليسترول لاعتماد النباتيون على الحليب والبيض.